La celebrazione del Giubileo dell'anno 2000 vede tra le mete più significative la città di Assisi. La scelta della città di San Francesco come una delle città simbolo di un così importante evento per la cristianità sottolinea ancor più l'ecumenismo della città umbra indicandola come meta per antonomasia del pellegrinaggio giubilare.
C'è un motivo anche storico che fa sì che da sempre Assisi sia una delle mete più importanti per i pellegrini di tutto il mondo e questo motivo è l'indulgenza del Perdono di Assisi che nel 1216 San Francesco riuscì ad ottenere dal Papa Innocenzo III. Tale indulgenza è legata alla Porziuncola in Santa Maria degli Angeli.

Così come Assisi si inserisce nei percorsi giubilari nazionali - assieme a Pompei, San Giovanni Rotondo, Loreto e Padova - all'interno della stessa città è possibile individuare un percorso giubilare che, toccando alcuni importanti edifici religiosi e culturali, consente di percorrere un cammino che prevede anche la Basilica di San Francesco.
Lungo tale percorso sono previste infatti tappe, ognuna delle quali rappresenta un passo verso il Giubileo e che testimonia sia la cristianità del luogo sia il luogo ove la fede è stata ispiratrice di capolavori dell'arte italiana e mondiale.